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Home / MLSA 프로젝트 / Step 1 · Sequence Upload

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Sequence Upload (AB1 / FASTA)

크로마토그램(.ab1 .ab) 또는 서열 파일(.fasta .fa .fas .fna)을 드래그하거나 클릭하여 업로드하세요. 두 형식 모두 아래 목록에서 같은 방식으로 쌍(F/R)·유전자를 확인합니다.

업로드 안내 (파일명 규칙 · FASTA · 샘플명) 파일명 규칙(권장): 샘플명_유전자_F.ab1 · 샘플명_유전자_R.ab1 · 단일 리드는 샘플명_유전자_S.ab1 (FASTA 도 동일: 샘플명_유전자_F.fasta)
이름 끝의 F / Fw / Fwd, R / Rv / Rev / rc4, S / Single을 인식합니다(대소문자·_ - . 무관).
규칙과 다르게 올려도 서열이 reverse-complement로 겹치는 리드는 쌍 후보로 제안되며, 아래 목록에서 방향(F/R/S)·쌍 묶기/분리를 직접 수정할 수 있습니다.
FASTA 업로드: 품질 정보가 없으므로 품질 트림 없이 서열 전체를 사용합니다. 한 파일에 서열이 여러 개면 각 서열(>헤더 이름)이 별도 샘플로 나뉩니다.
이미 다듬은 최종 서열이라면 방향을 S · Single로 두면 됩니다.
샘플명: 파일명에서 유전자·방향 표시를 뺀 앞부분으로 자동으로 정해지며, 카드 제목을 클릭해 수정할 수 있습니다(영문·숫자·_ - .).
같은 샘플(균주)로 묶기: 샘플명이 같은 카드는 Step 2 에서 하나의 샘플이 되고, Step 3 에서 유전자를 함께 골라 이어 붙인 트리를 그릴 수 있습니다.
 · 예) D987_ITS_F.ab1 D987_ITS_R.ab1 D987_COX2_F.ab1 D987_COX2_R.ab1 → 샘플 D987 (ITS + COX2)
 · 파일명이 규칙과 다르면(예: D987_cox2-rc4, D987_ITS1-O) 카드의 같은 샘플로 묶기에서 묶을 샘플을 고르거나(파일명 앞부분이 같은 카드만 목록에 나옵니다), 샘플명을 똑같이 고쳐 쓰면 됩니다.
 · 한 샘플에는 유전자마다 카드 하나만 둡니다. 묶은 카드가 같은 유전자로 판정되면 뒤의 카드는 샘플명_2 로 따로 등록됩니다.
 · 묶지 않은 카드끼리 자동 이름이 겹치면 _2 가 붙습니다.
같은 균주의 여러 유전자(예: ITS · COX2)는 샘플명을 하나로 통일하세요. 권장 파일명 균주명_유전자_F/R.ab1 (예: D987_ITS_F.ab1, D987_COX2_R.ab1)

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