| Gene |
Source |
Collected
(raw seqs) |
Merged
(99% cluster) |
Retained |
Length (merged)
min – max · avg |
Built |
Used in this project |
| ITS |
NCBI Nucleotide · pathogen-focused
250–1,200 bp
| 녹병 (Pucciniales) |
10,411 → 2,361 |
1,428 spp. |
| 흰녹가루병 (Albuginaceae) |
300 → 106 |
49 spp. |
| 노균병 (Peronosporaceae 중 역병 제외) |
2,973 → 515 |
483 spp. |
| 역병 (Phytophthora) |
20,667 → 1,547 |
728 spp. |
| 일반 진균 (base) |
19,829 → 9,675 |
4,581 spp. |
| 일반 난균류 (base) |
19,822 → 3,495 |
1,343 spp. |
|
74,002 |
17,699 |
23.9% |
250 – 1,200 bp · 604 bp |
2026-10-12 |
1 sample |
| LSU |
NCBI Nucleotide · pathogen-focused
300–1,500 bp
| 녹병 (Pucciniales) |
5,912 → 1,479 |
1,460 spp. |
| 노균병 (Peronosporaceae 중 역병 제외) |
1,789 → 343 |
265 spp. |
| 역병 (Phytophthora) |
2,147 → 132 |
304 spp. |
| 일반 진균 (base) |
4,683 → 2,276 |
2,160 spp. |
| 일반 난균류 (base) |
2,633 → 577 |
477 spp. |
|
17,164 |
4,807 |
28% |
300 – 1,494 bp · 821 bp |
2026-10-12 |
- |
| COX2 |
NCBI Nucleotide · pathogen-focused
300–1,200 bp
| 노균병 (Peronosporaceae 중 역병 제외) |
2,145 → 447 |
358 spp. |
| 역병 (Phytophthora) |
3,067 → 334 |
290 spp. |
| 흰녹가루병 (Albuginaceae) |
400 → 109 |
100 spp. |
| 일반 난균류 (base) |
2,150 → 479 |
311 spp. |
|
7,762 |
1,369 |
17.6% |
304 – 1,064 bp · 630 bp |
2026-10-12 |
1 sample |
| COX3 |
NCBI Nucleotide · pathogen-focused
200–1,500 bp
| 녹병 (Pucciniales) |
564 → 144 |
217 spp. |
| 일반 진균 (base) |
1,580 → 365 |
406 spp. |
|
2,144 |
509 |
23.7% |
261 – 1,333 bp · 570 bp |
2026-10-12 |
- |
Merged = 수집 서열을 99% 동일도 기준으로 묶은 대표 서열 수(유전자 판정에 실제 사용).
Retained = Merged ÷ Collected, 수집 서열 중 대표 서열로 남은 비율.
(base) = 대상 병원균 4종군 밖의 일반 진균·난균류. 대상 병원균이 아닌 서열이 억지로 가장 비슷한 병원균에 붙지 않도록 넣은 비교용 서열.
유전자 판정은 Merged 세트와 비교해 동일도 80% 이상이면 일치로 보며, AUTO 는 세트를 모두 비교해 가장 잘 맞는 유전자를 고릅니다.
